Отдавая дань уважения классическому SHMUP, Project Root отправляет игроков на передовую восстания, чтобы они сражались с бесконечной коллекцией вражеских самолетов, роями ракетных атак, легионами танков и участвовали в неистовых битвах с боссами, чтобы нанести удар по корню зла корпорации Prometheus. Бойцы имеют доступ к множеству улучшений кораблей, арсеналу взрывающихся самонаводящихся ракет, кассетных ракет и гигантских лазеров для усиления обороны.